Un accès privilégié aux données, aux échantillons biologiques et aux essais cliniques
Les patients sont au cœur de toutes les activités du PSCC. Ces derniers guident non seulement notre stratégie en matière d’innovation mais ils sont aussi partie prenante des projets soutenus par le cluster au travers des essais cliniques, des échantillons biologiques et des données associées et de l’implication du comité patients.
Pour accélérer les projets, nous mettons à la disposition des innovateurs une plateforme qui facilitera l’accès à ces trois ressources clefs.
L’une des priorités du PSCC est d’accélérer et rationaliser l’accès à ces données et de garantir leur standardisation, leur structuration, leur qualité et leur interopérabilité.
Données
L’oncologie de précision génère d’énormes quantités de données. Le défi est d’organiser, traiter, analyser et partager ces données mais aussi de les standardiser. Le PSCC travaille en collaboration avec ses partenaires à la création d'une plateforme dédiée pour faciliter l'accès aux données des patients disponibles dans les centres cliniques pour garantir l'interopérabilité et la qualité des données.
Ces données sont en effet très hétérogènes tant par leur nature (séquences d’ADN, profils d’expression, paramètres immunitaires, images…) que par leur langage (par exemple, les appareils d’imagerie utilisent tous le même langage informatique – processus DICOM - mais ce n’est pas le cas en biologie ni dans le monde des omiques…), leur type (études précliniques, cohortes, registres, essais cliniques…) ou leur localisation (de multiples centres de recherche et de soins, d’organisations…).
En outre, les médecins donnent beaucoup d’informations non structurées dans leur compte rendu (texte non requêtable) ou dans les systèmes d’informations très divers à l’hôpital.
Pour relever ce challenge, le cluster met en place :
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Un réseau fédéré de données (si ces dernières restent dans les établissements, les requêtes multisites seront désormais possibles),
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Un point d’entrée unique pour tous les porteurs de projet,
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Une aide aux établissements de santé afin qu’ils accélèrent les travaux engagés en matière de qualité et d’interopérabilité.
Ce projet rassemble déjà l’Institut Gustave Roussy, l’Institut Curie, le Centre Léon Bérard, l’AP-HP et l’hôpital Foch et sera amené à s’étendre à l’échelle nationale et européenne.
Alain Livartowski, Unicancer
Échantillons biologiques
Vers un accès accéléré et simplifié à des échantillons soigneusement préservés et annotés, ainsi qu'aux métadonnées associées.
Les biobanques font désormais partie du kit de base de la recherche translationnelle (identification et validation de cibles thérapeutiques, de biomarqueurs pronostiques, support aux essais précliniques…).
À l’heure du très haut débit (séquençage de nouvelle génération, microfluidique, plateforme de criblage…), le PSCC entend fédérer les acteurs français de l’oncologie pour accélérer et rationaliser l’accès à de gros volumes d’échantillons : cellules, tissus, liquides biologiques et produits dérivés) rigoureusement conservés et annotés ainsi qu’aux métadonnées associées.
Essais cliniques
La division de recherche clinique Gustave Roussy est la plus réputée en France et l'une des plus reconnues dans le monde. Elle comprend une équipe de professionnels hautement qualifiés, y compris des médecins de recherche clinique seniors, des chefs de projet, des pharmaciens, des statisticiens, des responsables des affaires réglementaires, des experts en pharmacovigilance, des gestionnaires de données et des attachés de recherche clinique.
La plateforme Essais Cliniques de Gustave Roussy offre aux porteurs de projets du PSCC un accès privilégié aux principaux leaders d'opinion et une gamme complète de services pour soutenir le développement d'un essai clinique et, le cas échéant, pour assumer le parrainage de l'étude conformément aux procédures institutionnelles pertinentes.
Benjamin Besse, Gustave Roussy